Des étudiants créent des vidéos à visée pédagogique sur la bioinformatique.

Les évolutions importantes en bioinformatique, depuis le début des années 2000, ont entraîné le besoin pour la communauté, notamment les étudiants en cursus de biologie particulièrement à partir de la troisième année de Licence Sciences de la Vie, de mettre à jour les connaissances et compétences techniques dans cette discipline. L’objectif de ce projet était donc de répondre à ce besoin de manière originale grâce une méthode dite « par les pairs », en faisant réaliser de courtes vidéos explicatives par des étudiants pour leurs camarades. 

Les deux enseignants à l’origine du projet, Audey Queudet et Stéphane Téletchéa, ont déposé une demande auprès du Fonds de Développement de la Pédagogie de la Faculté en janvier 2023. Ils ont ensuite monté un groupe d’une dizaine d’étudiants et encadré le projet, entre fin février et septembre 2023. Alors qu’à l’origine la conception d’un ensemble de 6 vidéos était envisagée, , les étudiants se sont fortement mobilisés pour aboutir à la création d’un total de 10 vidéos !

Après une étape collective de vérification et la validation des vidéos par l’équipe pédagogique, les vidéos ont ainsi pu être mises en ligne dans une sous-chaîné entièrement dédiée sur la chaîne WebTV de la Faculté des sciences et des techniques :

• Découverte de la bioinformatique
• Conseils et bonnes pratiques en bioinformatique
• Découverte de la bioinformatique structurale
• Gestion de projet informatique collaboratif avec github ou gitlab
• Installation et découverte de GNU/Linux
• Logiciel R – Tests statistiques
• Logiciel R – Création de graphiques
• Logiciel R – Découverte de R Studio
• Découverte de KeGG
• Découverte de PyMOL

Ces vidéos pédagogiques sont en accès libres sur la WebTV et sont également utilisées dans le cadre des enseignements suivants : Génie Logiciel (M1), de Bioinformatique Structurale (M1) ou de Biologie des Systèmes (M2).

L’équipe du projet :

Encadrement :

• Audrey Queudet, MCF et Directrice du Département Informatique, Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N, UMR CNRS 6004).
• Stéphane Téletchéa, MCF spécialiste de bioinformatique structurale, Unité en Sciences Biologiques et Biotechnologies (US2B, UMR CNRS 6286)

Etudiants :

• Daniel Batteux, étudiant en Master 2 Bioinformatique
• Naomie Belletoise, étudiante en Master 2 BMTI
• Samuel Besseau, étudiant en Master 2 Bioinformatique
• Louis Closson, étudiant en Master 2 Bioinformatique, en alternance dans l’entreprise Affilogic
• Lucas David, doctorant à l’Institut de Chimie de Nice (après son Master de Bioinformatique à Nantes)
• Florian Echelard, doctorant en Deep Learning appliqué aux Sciences de la Vie à l'Universitetet i Berge (après son Master de Bioinformatique à Nantes)
• Charlotte Garraud, étudiante en Master 2 Bioinformatique, en alternance dans l’entreprise Hopinnov
• Manon Guibot, étudiante en Master 2 de biostatistique
• Schama Zannou, étudiant en Master 2 Bioinformatique

Accompagnement :

• Audiovisuel : Guillaume Olympiade, Service Commun Informatique
• Pédagogie : Claire Flandrin et François LLorca, Pôle Pédagogie