Sciences et techniques
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Formation LMD

Master Bio-informatique

Mention concernée :  Bio-informatique
Diplôme national de master contrôlé par l'État

Résumé

La mention Bioinformatique est dédiée à la formation de cadres scientifiques et d'ingénieurs bioinformaticiens ayant une formation initiale en biologie. En savoir plus

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Call to actions

Détails

Alternance

Le parcours M2 Ingénierie Bioinformatique (IB) est ouvert en alternance via un contrat de professionnalisation. Le planning et le programme de l'alternance sont communiqués sur cette page dans la partie "Programme".
Structure(s) de rattachement
Durée de la formation
  • 2 ans
Lieu(x) de la formation
Nantes
Stage(s)
Oui, obligatoires

Capacité d'accueil de la mention

Année 2023-2024

Pour la 1ère année de Master : 40

Pour la 2ème année de Master : 36

Taux de réussite des alternants M2 (2022-2023) : *
100%
* Le taux de satisfaction des alternants M2 (2022-2023) est de 100%. Le taux de réussite global des étudiants (année de référence 2022) est : 97%

Candidatures

  • Master 1 : Phase complémentaire de candidature ouverte jusqu'au 30 juin 2024 sur "Mon Master", la plateforme nationale des masters.
  • Master 2 : Candidatures ouvertes du 26 février au 24 mars 2024 sur le site de candidature de Nantes Université.

Présentation

Le Master mention Bioinformatique de Nantes Université propose une formation classique et une modalité par alternance.
La première année de formation (M1) est commune à la formation classique et à la modalité par alternance. Seul le M2 peut s'effectuer en alternance.


Formation classique : devenez cadre bioinformaticien·ne
La modalité classique du Master 2 Bioinformatique a pour objectif la maîtrise du traitement automatique des données issues du vivant et elle dote les jeunes diplômé·es de solides compétences en programmation en informatique.
À l’issue de la formation, les éudiant·es de ce Master possèdent un profil de cadre en bioinformatique avec de solides compétences en programmation en informatique.
Les diplômé·es peuvent ainsi intégrer le secteur public ou privé, notamment le domaine de la santé, spécifiquement comme ingénieur d’étude en bioinformatique.
Une partie des diplômé·es choisissent de compléter leur formation en poursuivant en Doctorat, en France ou à l’étranger, afin de devenir ingénieur·e de recherche ou chercheur/chercheuse, en bioinformatique ou en biologie doté de compétences en informatique.

Formation en alternance : gestionnaire de bases de données biologiques
La modalité par alternance, qui comporte des enseignements communs avec la formation classique, vise à former des cadres bioinformaticien·nes avec une immersion en entreprise, pendant la deuxième année de Master (M2 - taux de réussite 2022-2023 : 100% | taux de satisfaction 2022-2023 : 100%)
À l’issue de la formation, les étudiant·es auront acquis  des connaissances approfondies et savoir-faire avancés leur permettant de mieux appréhender le domaine de la bioinformatique, à la charnière entre biologie, biostatistique et informatique.
Les diplômé·es seront en mesure de concevoir et de réaliser des projets en bioinformatique ou en informatique pour répondre à un cahier des charges ou à un questionnement scientifique.
Les diplômé·es accèdent à des fonctions de niveau ingénieur·e en bioinformatique ou informatique dans divers domaines d’activités, dans le secteur public ou privé :
santé et médical, agroindustries, industrie pharmaceutique, environnement, plateformes bioinformatiques, entreprises de biotechnologies, sociétés de conseil et d’expertise scientifique, structures de recherche... mais aussi au sein d’Entreprises de Services du Numérique (ESN).

Objectifs

Un lien fort avec la recherche
Les enseignant·es du Master effectuent leurs recherches au sein de laboratoires ligériens reconnus internationalement pour leur expertise en en biologie humaine, animale ou végétale, dans les secteurs de la santé, des biotechnologies ou de la biologie fondamentale.
Par ailleurs, les besoins croissants des structures de recherche dans ce domaine induisent une augmentation de l'offre de stages et d'emplois pour des étudiant·es biologistes ayant de solides compétences en programmation informatique.

Un enseignement qui s'adapte aux étudiants
En Master 2, les alternant·es suivront une partie des enseignements à distance, pour leur permettre de rester dans leur entreprise d'accueil.
Des innovations pédagogiques (par ex : classes inversées) ont été mises en place ces dernières années pour certains cours afin d'impliquer fortement les étudiant·es dans leur formation et favoriser ainsi leur réussite.
Un nouveau système de notation est expérimenté dans certains enseignements, à l'instar de ce qui se pratique dans des écoles d'ingénieurs (par ex : grilles critériées, résultats d'apprentissage, ...).

Lieux

Nantes

Partenariats

Laboratoires

Les laboratoires de soutien sont : INSERM UMS 016, CNRS UMS 3556, FED 4203, CHU de Nantes, FED 4208, Unité INSERM UMR 1087 / CNRS 6291, UMR CNRS 6286, Unité de Recherche INRA 1268, UMR INRA 1300, ONIRIS / Laboratoire d'Etude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Ecosystèmes Microbiens et Molécules Marines pour les Biotechnologies (IFREMER-EM3B), Laboratoire Physiologie et Biotechnologie des Algues de l'Unité Biotechnologie et Ressources Marines (IFREMER), UMR INSERM 1089, UMR 892 INSERM / 6299 CNRS, EA 4275, SPHERE, EA 1157, INSERM U 791, INSERM UMR 957, UMR CNRS 6214 - INSERM 1083, INRA UMR 1345.

Admission

Pré-requis

Formation(s) requise(s)

Mentions de Licences conseillées : Sciences de la Vie, Sciences de la Vie et de la Terre, Chimie (mais avec un parcours chimie-biologie)


Attendus et critères d'examen des candidatures

Candidature

Modalités de candidature

Accès sélectif

En master 1:

Procédure de candidature pour l'année universitaire 2023-2024

  • Pour connaître les dates d'ouverture et de fermeture de la plateforme et déposer votre candidature en M1, consultez la page Candidature en Master
  • Master 1 : Phase complémentaire de candidature ouverte jusqu'au 30 juin 2024 sur "Mon Master", la plateforme nationale des masters.

En Master 2 :

Modalités de candidature spécifiques

Pour en savoir plus sur les candidatures en alternance ou formation continue : www.univ-nantes.fr/focal

Programme

Contenu de la formation

Pour en savoir plus sur le contenu de ce master, téléchargez les programmes :

Alternance 2024-2025 du M2 Bioinformatique :

Et après ?

Niveau de sortie

Bac+5 (Niveau 7)

Compétences visées

Compétences techniques :
  • Vous serez capable d'identifier et d'intégrer différents modèles, méthodes, algorithmes et techniques en vue du développement d'applications logicielles de difficulté moyenne à élevée, et destinées au traitement des données du vivant.
  • Vous posséderez une connaissance générale des principaux modèles utilisés en biostatistique et des applications de la biostatistique en recherches biologique, biomédicale et clinique.
Autonomie et adaptabilité :
  • Vous mettrez en relation des connaissances et des savoir-faire relatifs à différents domaines de la bioinformatique, de la biologie et de l'informatique ; en acquerrez de nouveaux, et les utiliserez à bon escient pour traiter un problème.
  • Vous mettrez en œuvre, coordonnerez, analyserez et valoriserez un projet en bioinformatique.
  • Vous organiserez votre temps de travail, saurez prendre des contacts et collaborer dans un contexte interdisciplinaire.
  • Vous serez actif dans la veille sur les avancées technologiques en biologie, en informatique et communication tout en y portant un regard critique en faisant la preuve de votre indépendance intellectuelle.
  • Vous serez capable de prendre des décisions et de mettre en œuvre des actions en respectant un code éthique.
Communication :
  • Vous maîtriserez les techniques de communication usuelle (diaporama, mémoire, poster …) et les utiliserez, documenterez des applications logicielles et formerez divers publics à leur utilisation.
  • Vous formaliserez, maîtriserez le développement d'argumentaires ou de discussions (critiques, techniques ou sur des résultats de travaux), et vous serez en capacité d'exposer ces développements en vous adaptant au public (initié ou non, jeune ou adulte ...).
  • Vous maîtriserez l'anglais de votre domaine professionnel
Travail en équipe :
  • Vous écouterez, échangerez, serez capable d'interagir au sein d'une équipe à courte, à moyenne et longue échéances, et vous serez en capacité d'animer un groupe de travail.
  • Vous serez apte aux collaborations dans un contexte interdisciplinaire, et notamment en lien avec des partenaires informaticiens, mathématiciens, statisticiens ou biologistes.

Et selon votre parcours de M2, des compétences disciplinaires viendront renforcer ce socle.

Référentiels de compétences : RNCP, Répertoire spécifique, RAC, ...

Consulter la fiche RNCP n° 38964 relative à ce diplôme
Concernant les Licences, Licences professionnelles et Master, enregistrés de droit au RNCP, une fiche nationale permet de définir les dénominateurs communs au niveau de la mention du diplôme pour chacune des universités proposant cette mention.

Qu'est ce que le RNCP?

Le répertoire national de la certification est une grande base de données nationale qui recense l'ensemble des formations reconnues en France incluant les compétences attendues, les modalités d'accès ou encore des informations sur le parcours et la pédagogie. Nantes Université a fait le choix de présenter son offre de formation en y intégrant les fiches RNCP. Le RNCP contient des fiches descriptives de chaque formation. L'objectif étant de rendre visible et attractive l'offre de formation.

Poursuites d'études

Après le Master, vous pourrez également poursuivre vos études en thèse de Doctorat (bac+8). Il vous est possible d'effectuer ce Doctorat dans le cadre d'une convention CIFRE, avec une collaboration laboratoire/entreprise.

Débouchés professionnels

Secteurs d'activité ou type d'emploi

Domaines :
A l'issue de ce master, vous pourrez mettre en œuvre vos compétences dans des domaines d’activités variés, dans le secteur public ou privé : santé et médical, agroindustries, industrie pharmaceutique, environnement (terrestre et marin), plateformes bioinformatiques, entreprises de biotechnologies, sociétés de conseil et d'expertise scientifique, structures de recherche, ... mais aussi au sein d'Entreprises de Services du Numérique (ESN).

Métiers :

  • Ingénieur d'étude ou de recherche en bioinformatique
  • Ingénieur en Recherche & Développement
  • Chef de projet pour des applications biomédicales, développement de logiciels gestionnaires ou systèmes informatiques...
  • Cadre dans la santé, à l'interface entre l'informatique et le médical
  • Gestionnaire de banque de données biologiques
  • Responsable de plateforme technologique (après quelques années d'expérience professionnelle)
  • Chercheur en bioinformatique, en biologie ou en informatique (après une thèse de Doctorat)

Insertion professionnelle

Pour en savoir plus sur le devenir de nos diplômés, consultez les enquêtes d'insertion professionnelle réalisées par le SUIO.

Contacts

Renseignement
Christine Sinoquet | Responsable du M1 Bioinformatique/Biostatistique
christine.sinoquet@univ-nantes.fr

Christine SINOQUET et Bernard OFFMANN | Co-responsables du M2 classique
christine.sinoquet@univ-nantes.fr | bernard.offmann@univ-nantes.fr

Bernard OFFMANN, Stéphane TELETCHEA et Christine SINOQUET | Co-responsables du M2 en alternance
bernard.offmann@univ-nantes.fr | stephane.teletchea@univ-nantes.fr | christine.sinoquet@univ-nantes.fr

Mis à jour le 24 septembre 2024.
https://sciences-techniques.univ-nantes.fr/formations/masters/master-bio-informatique