Stages - M2 Génétique, Génomique et Biologie des Systèmes (GGBS)

Liste des stages disponibles pour le parcours GGBS du master Biologie Santé

STAGE 2018-2019


Titre du stage : Etude de la régulation de l’expression des antigènes du soi dans le thymus – rôle dans la protection contre les maladies autoimmunes
Laboratoire : CRTI - UMR1064 INSERM
Intitulé/N° d’équipe : Equipe 2
Nom-Prénom de l’encadrant : GIRAUD Matthieu
Courriel de l’encadrant : matthieu.giraud@univ-nantes.fr

Titre du stage : Mécanisme de résistance aux inhibiteurs de la voie PI3K/mTOR et aux RTK dans l’ostéosarcome
Laboratoire : INSERM UMRs 1238 PhyOs
Intitulé/N° d’équipe : Equipe 3 Epistress
Nom-Prénom de l’encadrant : LAMOUREUX Francois
Courriel de l’encadrant : francois.lamoureux@univ-nantes.fr

Titre du stage : Identification et compréhension du rôle des régions régulatrices du génome humain chez des patients atteints de pathologies cardiaques
Laboratoire : Unité de recherche de l’institut du thorax
Intitulé/N° d’équipe : Équipe I : Génétique cardiovasculaire
Nom-Prénom de l’encadrant : Julien Barc
Courriel de l’encadrant : julien.barc@inserm.fr

Titre du stage : Impact des traitements sur les récidives tumorales de Glioblastome​​​​​​​
Laboratoire : CRCINA
Intitulé/N° d’équipe : 14
Nom-Prénom de l’encadrant : Pecqueur Claire
Courriel de l’encadrant : claire.pecqueur@univ-nantes.fr​​​​​​​

Titre du stage : Inhibition de cibles métaboliques dans les primocultures de GBM par CRISPR-Cas9
Laboratoire : CRCINA
Intitulé/N° d’équipe : 14
Nom-Prénom de l’encadrant :Pecqueur Claire
Courriel de l’encadrant : ​​claire.pecqueur@univ-nantes.fr​​​​​​​

Titre du stage : Génération de Tregs à partir de cellules iPS
Laboratoire : CRTI, UMR 1064
Intitulé/N° d’équipe : 2
Nom-Prénom de l’encadrant : Guillonneau Carole
Courriel de l’encadrant : carole.guillonneau@univ-nantes.fr​​​​​​

Titre du stage : Investigation d l’hétérogénéité cellulaire par scRNAseq durant la transplantation
Laboratoire : Epigenetique
Intitulé/N° d’équipe : 1
Nom-Prénom de l’encadrant : Poschmann Jeremie
Courriel de l’encadrant : jeremie.poschmann@univ-nantes.fr​​​​​​​

Titre du stageInvestigation des altérations épigénétiques durant la transplantation
Laboratoire : Epigenetique
Intitulé/N° d’équipe : 1
Nom-Prénom de l’encadrant : Poschmann Jeremie
Courriel de l’encadrant : jeremie.poschmann@univ-nantes.fr​​​​​​​

Titre du stageEtude fonctionnelle de mutations de gènes de la voie de l'hypoxie identifiées chez des patients atteints de polyglobulies héréditaires.
Laboratoire : Unité de recherche de l'institut du thorax, Inserm UMR 1087/CNRS UMR 629
Intitulé/N° d’équipe : Equipe de Génétique Médicale
Nom-Prénom de l’encadrant : Betty Gardie
Courriel de l’encadrant : betty.gardie@univ-nantes.fr​​​​​​​

Titre du stageIdentification des mécanismes physiopathologiques impliqués dans la déficience intellectuelle (DI) causée par des altérations de la voie Ubiquitine-Protéasome.
Laboratoire : Unité de recherche de l'institut du thorax, Inserm UMR 1087/CNRS UMR 629
Intitulé/N° d’équipe : Equipe de Génétique Médicale
Nom-Prénom de l’encadrant : Stéphane Bézieau
Courriel de l’encadrant : stephane.bezieau@chu-nantes.fr​​​​​​​

Titre du stageMise en évidence d’anomalies génomiques dans le myélome multiple en combinant des approches de Chip-seq à des analyses computationnelles innovantes
Laboratoire : Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie de Nantes - Angers (CRCINA) INSERM U1232 – IRS-UN
Intitulé/N° d’équipe : Oncogénomique intégrative de la pathogénicité et de la progression du myélome multiple (CRCINA équipe 11 dirigée par Stéphane Minvielle DR CNRS)
Nom-Prénom de l’encadrant : Victor Gaborit (Doctorant INSERM) / Florence Magrangeas (Chercheur) / Stéphane Minvielle (DR CNRS)
Courriel de l’encadrant : victor.gaborit@univ-nantes.fr


Titre du stage : Analyse du réseau de régulation transcriptionnelle dans le myélome multiple
Laboratoire : Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie de Nantes - Angers (CRCINA) INSERM U1232
Intitulé/N° d’équipe : Oncogénomique intégrative de la pathogénicité et de la progression du myélome multiple (CRCINA équipe 11 dirigée par Stéphane Minvielle DR CNRS)
Nom-Prénom de l’encadrant : Aurélien Sérandour (MC, Ecole Centrale de Nantes - chaire Inserm)
Courriel de l’encadrant : aurelien.serandour@ec-nantes.fr

STAGE 2017-2018

Pour rappel les dates de stage à indiquer sur les conventions :
du lundi 4/12/2017 au vendredi 15/12/2017 inclus et du jeudi 4/01/2018 au vendredi 15/06/2018 inclus.


Etude d’association épigénome-entier (EWAS) de la bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO)
Encadrante : Sophie Limou
Laboratoire : Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (CRTI) - Inserm UMR1064  - Equipe ATIP-Avenir (PA Gourraud), 30 bd Jean Monnet, Nantes
Résumé du stage ici

Analyse des interactions neuro-mésenchymo-épithéliale par bulk mRNAseq et cytométrie de masse (CyTOF) dans des organoïdes intestinaux dérivés des cellules souches pluripotentes humaines. 
Encadrant: Maxime Mahe
Laboratoire: INSERM UMR 1235  équipe TENS
Résumé du stage ici


Analyse de la structure Génétique Fine d’une population de l'Ouest de la France 
Encadrant: Christian Dina
Laboratoire: Institut du Thorax UMR 1087 / CNRS UMR 6291
Resumé du stage ici
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Reconstruction à l'échelle génomique du réseau métabolique de l'algue brune Saccharina japonica 
Encadrants: Markov, Gabriel
Laboratoire: UMR 8227 CNRS-UPMC, Station Biologique de Roscoff
Résumé du stage ici


Investigation des altérations épigénétiques durant la transplantation 
Encadrant: Jeremie Poschmann 
Laboratoire: CRTI UMR 1064 
Résumé du stage ici

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Développement de single cell RNA-seq pour quantifier l’hétérogénéité des cellules immunitaires en transplantation et auto-immunité 
Encadrant: Jeremie Poschmann 
Laboratoire: CRTI UMR 1064 
Résumé du stage ici

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Succession et rôle du microbiome épiphyte lors de la dégradation de l’algue brune Laminaria hyperborea
Encadrants:  Dr. Angélique Gobet  et Dr. François Thomas  
Laboratoire :     Station Biologique de Roscoff, UMR8227 (CNRS-UPMC)    
Résumé du sujet

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Epigénomique du myélome multiple

Encadrant : Aurélien Sérandour
Laboratoire : INSERM UMR1232 (CRCINA), équipe 11
Résumé du sujet

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Analyse de la plasticité des lymphocytes T humains Vg9Vd2 *
Encadrant : Emmanuel Scotet
Laboratoire : INSERM UMR1232 (CRCINA), équipe 1
Résumé du sujet

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Médecine de précision : Contextualisation populationelle et temporalité clinique
Encadrant : Pierre-Antoine Gourraud
Laboratoire : INSERM UMR1064, ATIP-Avenir Team 5
Résumé du sujet

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Génétique de la mort subite cardiaque
Encadrant : Julien Barc
Laboratoire : INSERM UMR1087 / CNRS UMR6291 (l'institut du thorax), équipe 1 (Génétique cardiovasculaire)
Résumé du sujet

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Identification de nouveaux réseaux transcriptionnels de PCSK9 *
Encadrant : Karim Si-Tayeb
Laboratoire : INSERM UMR1087 / CNRS UMR6291 (l'institut du thorax), équipe 4 (Dyslipidémies et lipotoxicité)
Résumé du sujet

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* Candidat pressenti